กองยานพาหนะอาคารและสถานที่เป็นหน่วยงานในสังกัดสำนักงานอธิการบดีได้จัดตั้งขึ้นเมื่อประมาณ ปี พ.ศ. 2514 ครั้งแรกชื่อว่า หน่วยบริการกลาง มีหน้าที่ให้บริการต่าง ๆ อาทิ ด้านยานพาหนะ สาธารณูปโภค อาคารสถานที่ ต่อมาได้รับการแบ่งส่วนราชการมีฐานะเป็นกองหนึ่งในจำนวน 7 กองของสำนัก งานอธิการบดีตามประกาศสำนักนายกรัฐมนตรีเรื่องการแบ่งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ (ฉบับที่ 3)

ปัจจุบัน กองยานพาหนะอาคารและสถานที่ มีหน้าที่ให้บริการและสนับสนุนด้านยานพาหนะ สาธารณูปโภค อาคารสถานที่ ความปลอดภัย สวนและรักษาความสะอาด ในพื้นที่เกษตรกลางบางเขน ที่อยู่ในความรับผิดชอบของมหาวิทยาลัยเพื่อสนับสนุนให้การดำเนินกิจกรรมตามภารกิจของมหาวิทยาลัยให้  บรรลุตามเป้าหมายและมีประสิทธิภาพ ซึ่งมหาวิทยาลัยได้แบ่งส่วนราชการภายในออก เป็น 8 งาน ได้แก่

1. งานบริหารและธุรการ 2. งานอาคารและสถานที่ 3. งานซ่อมบำรุง 4. งานยานพาหนะ 5. งานสวนและรักษาความสะอาด 6. งานรักษาความปลอดภัย 7. งานบำรุงรักษาอาคารกิจการนิสิต 8. งานบริหารกลุ่มงานอาคารพิเศษ